性病病原體不一，其治療用藥也不一樣，衛生部防疫司在《性病防治手冊》中提出了各種性病治療的具體用藥。在臨床工作中大部分是行之有效的，但也有不足之處。總體來說，性病用藥的原則有：明確診斷，及時用藥；選用針對性強的藥物，尤其是在臨床上及文獻中報道有效的藥物；有可能做藥敏檢查的病原體，比較好根據藥敏結果用藥；能選用口服藥者，先選用口服藥，必要時選用肌肉注射及輸液治療；治療周期根據不同疾病而異，不宜過長；注意合并感染多種性病的治療；減少或不使用預防性用藥。